36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4482 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  73.24 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  46.53 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  46.53 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  50.35 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  43.57 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  44.29 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  47.52 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  42.03 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  42.75 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  46.43 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  43.8 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  41.67 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  40.97 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  40.71 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  44.29 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  43.07 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  42.25 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  43.57 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  47.14 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  41.43 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  41.61 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  40.88 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  41.43 
 
 		 170 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  45 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  42.14 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  42.14 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  40 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  41.01 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  31.88 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  41.27 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>