27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3435 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  50.69 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  41.41 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  33.94 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  34.41 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  35.14 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  32.85 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  34.7 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  35.59 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  32.21 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  34.25 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  30.04 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  33.93 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  33.17 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  27.7 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  32.35 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  31.98 
 
 		 276 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.89 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  29.05 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.65 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1171  Chorismate binding-like protein  28.85 
 
 		 732 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416278  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  23.64 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>