151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1788 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  75.81 
 
 
312 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  61.81 
 
 
313 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  53.85 
 
 
314 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  55.95 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  51.45 
 
 
312 aa  322  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  51.31 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  47.74 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  50.65 
 
 
314 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  49.35 
 
 
314 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  47.27 
 
 
330 aa  295  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  51.75 
 
 
310 aa  295  6e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  45.71 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  45.71 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  45.4 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  50.65 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  49.04 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  48.56 
 
 
313 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  49.52 
 
 
321 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  50.32 
 
 
310 aa  279  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  48.23 
 
 
320 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  48.22 
 
 
311 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  48.22 
 
 
311 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  48.08 
 
 
318 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  48.55 
 
 
320 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  47.91 
 
 
320 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  46.95 
 
 
319 aa  276  3e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  47.8 
 
 
314 aa  276  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  48.87 
 
 
298 aa  275  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  47.59 
 
 
320 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  47.59 
 
 
320 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  47.74 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  47.6 
 
 
322 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  47.6 
 
 
322 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  48.23 
 
 
317 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  49.68 
 
 
310 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  48.26 
 
 
313 aa  269  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  45.63 
 
 
314 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  44.52 
 
 
307 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  47.62 
 
 
316 aa  265  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  46.5 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  46.28 
 
 
314 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  44.87 
 
 
317 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  45.69 
 
 
317 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  47.88 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  48.52 
 
 
309 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  45.4 
 
 
310 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  48.25 
 
 
316 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  44.73 
 
 
317 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  45.05 
 
 
314 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  45.08 
 
 
310 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  47.78 
 
 
312 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  45.08 
 
 
310 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  45.08 
 
 
310 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  45.08 
 
 
310 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  44.79 
 
 
310 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  44.79 
 
 
310 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  46.25 
 
 
318 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  45.08 
 
 
310 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  44.92 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  44.92 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  47.87 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  47.13 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  47.28 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  46.75 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  47.62 
 
 
316 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  47.39 
 
 
310 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  47.62 
 
 
316 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  47.94 
 
 
316 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  47.54 
 
 
309 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  47.62 
 
 
316 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  47.87 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  46.3 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  47.62 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  44.63 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  42.58 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  42.81 
 
 
311 aa  252  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  42.48 
 
 
304 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  46.73 
 
 
310 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  47.62 
 
 
316 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  47.3 
 
 
316 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  44.16 
 
 
310 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  46.38 
 
 
308 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  44.16 
 
 
310 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  44.16 
 
 
310 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  43.83 
 
 
310 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  43.83 
 
 
310 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  45.19 
 
 
312 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  44.01 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  45.25 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  42.26 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  43.37 
 
 
303 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  44.59 
 
 
312 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  46.18 
 
 
309 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  45.25 
 
 
309 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  46.25 
 
 
324 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  42.86 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.41 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  43.83 
 
 
303 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  43.28 
 
 
314 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>