More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1260 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  67.4 
 
 
464 aa  675  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  62.96 
 
 
471 aa  639  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  100 
 
 
469 aa  959  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  7.85433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  67.46 
 
 
463 aa  683  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  67.84 
 
 
464 aa  676  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  58.81 
 
 
467 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  54.85 
 
 
470 aa  540  1e-152  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  52.05 
 
 
470 aa  512  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  51.26 
 
 
476 aa  512  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  51.09 
 
 
475 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  53.15 
 
 
467 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  50.74 
 
 
469 aa  509  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  54.19 
 
 
488 aa  511  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  51.05 
 
 
476 aa  511  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  51.79 
 
 
471 aa  507  1e-142  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  53.26 
 
 
465 aa  505  1e-142  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  50.63 
 
 
476 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  53.03 
 
 
465 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  48.85 
 
 
476 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  51.84 
 
 
469 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  50.54 
 
 
475 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  53.64 
 
 
471 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  52.13 
 
 
465 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  50.54 
 
 
472 aa  493  1e-138  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  52.37 
 
 
469 aa  493  1e-138  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  52.23 
 
 
468 aa  490  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  49.55 
 
 
470 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  51.14 
 
 
465 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  50.91 
 
 
465 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  51.14 
 
 
465 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  50.91 
 
 
466 aa  486  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  51.37 
 
 
465 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  51.37 
 
 
465 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  51.14 
 
 
465 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  51.14 
 
 
465 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  50.91 
 
 
472 aa  485  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  50.54 
 
 
471 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  51.14 
 
 
465 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  49.66 
 
 
470 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  51.14 
 
 
465 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  50.91 
 
 
465 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  51.14 
 
 
470 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  49.43 
 
 
470 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  50.92 
 
 
463 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  51.02 
 
 
477 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  50.56 
 
 
472 aa  484  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  50.57 
 
 
552 aa  480  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  51.48 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  49.89 
 
 
487 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  48.97 
 
 
480 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  51.01 
 
 
471 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  50.68 
 
 
470 aa  478  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  47.99 
 
 
472 aa  478  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  48.75 
 
 
470 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  9.12442e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  48.29 
 
 
485 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  48.97 
 
 
487 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  48.52 
 
 
485 aa  475  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  51.01 
 
 
471 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.87 
 
 
482 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  49.2 
 
 
479 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  49.2 
 
 
470 aa  475  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  48.29 
 
 
481 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  48.53 
 
 
473 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  47.61 
 
 
479 aa  475  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  50.23 
 
 
465 aa  472  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  49.11 
 
 
469 aa  470  1e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.38 
 
 
483 aa  470  1e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  48.52 
 
 
481 aa  471  1e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.97 
 
 
470 aa  471  1e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  49.54 
 
 
472 aa  471  1e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  47.61 
 
 
470 aa  467  1e-130  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.98 
 
 
490 aa  467  1e-130  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  45.55 
 
 
472 aa  467  1e-130  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  47.38 
 
 
476 aa  466  1e-130  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  49.77 
 
 
465 aa  467  1e-130  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  47.61 
 
 
485 aa  466  1e-130  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  49.77 
 
 
465 aa  467  1e-130  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  46.7 
 
 
479 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  46.7 
 
 
476 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  7.06368e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  46.29 
 
 
470 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.06 
 
 
482 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  46.92 
 
 
479 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  49.2 
 
 
466 aa  460  1e-128  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  46.01 
 
 
487 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  48.06 
 
 
477 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  46.07 
 
 
470 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  46.01 
 
 
487 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  48.52 
 
 
478 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  46.01 
 
 
487 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  48.86 
 
 
462 aa  454  1e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  46.24 
 
 
481 aa  454  1e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.97 
 
 
475 aa  453  1e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  48.51 
 
 
483 aa  448  1e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  47.19 
 
 
476 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  48.74 
 
 
479 aa  441  1e-122  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  46.92 
 
 
470 aa  425  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  45.78 
 
 
486 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  42.53 
 
 
478 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  44.42 
 
 
474 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0613  FeS assembly protein SufB  45.06 
 
 
473 aa  388  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>