27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0066 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 
274 aa  570  1e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  1.3205e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  570  1e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  100 
 
 
278 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  99.27 
 
 
274 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  98.91 
 
 
274 aa  563  1e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  98.54 
 
 
274 aa  561  1e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  97.08 
 
 
274 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  84.31 
 
 
274 aa  474  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  67.16 
 
 
362 aa  391  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  66.54 
 
 
281 aa  381  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  58.17 
 
 
285 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  49.62 
 
 
295 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  35.82 
 
 
287 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  36.57 
 
 
289 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  36.43 
 
 
288 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  38.52 
 
 
284 aa  155  5e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  37.98 
 
 
281 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  36.13 
 
 
287 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  36.08 
 
 
284 aa  140  2e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  53.15 
 
 
123 aa  136  3e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  33.59 
 
 
269 aa  134  2e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  42.67 
 
 
187 aa  121  1e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  47.22 
 
 
412 aa  114  2e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  29.07 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  41.53 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  32.14 
 
 
186 aa  75.9  7e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  41.18 
 
 
92 aa  63.5  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>