38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5791 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  327  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  58.71 
 
 
155 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  48.37 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  44.14 
 
 
170 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  39.46 
 
 
172 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  39.47 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  39.58 
 
 
173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  40.28 
 
 
172 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  38.62 
 
 
169 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  38.16 
 
 
170 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  38.16 
 
 
170 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  38.19 
 
 
173 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  38.22 
 
 
337 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  35.33 
 
 
173 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  36.09 
 
 
215 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  34.16 
 
 
162 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  36.69 
 
 
216 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  35.58 
 
 
200 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  34.16 
 
 
198 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  33.13 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  34.21 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  30.63 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  27.54 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  29.3 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  29.3 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  33.12 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  27.54 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  30.61 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  30.61 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  30.61 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2467  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.206216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  30.08 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  31.62 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2644  hypothetical protein  47.37 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  29.68 
 
 
225 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  26.19 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>