More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1213 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
529 aa  1047    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.64 
 
 
310 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
311 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.39 
 
 
311 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.33 
 
 
311 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.99 
 
 
352 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.08 
 
 
316 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.61 
 
 
321 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.8 
 
 
309 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.79 
 
 
314 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7738  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.93 
 
 
320 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.71 
 
 
308 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.45 
 
 
321 aa  183  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000276676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.76 
 
 
305 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  33.44 
 
 
329 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  37.72 
 
 
320 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000664763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.94 
 
 
356 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.27 
 
 
317 aa  182  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.77 
 
 
312 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.37 
 
 
310 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.67 
 
 
309 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0853  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.41 
 
 
305 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.560676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  35.07 
 
 
305 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.05 
 
 
322 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.02 
 
 
369 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.58 
 
 
313 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.58 
 
 
316 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000276726  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3557  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.21 
 
 
309 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.75 
 
 
314 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.61 
 
 
321 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  32.12 
 
 
315 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.15 
 
 
309 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.95 
 
 
317 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.88 
 
 
319 aa  176  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.04 
 
 
311 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.28 
 
 
310 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.98 
 
 
311 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.27 
 
 
320 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.51 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
309 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1464  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.54 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  32.98 
 
 
310 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.34 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.55 
 
 
323 aa  173  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.96 
 
 
311 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  34.36 
 
 
307 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.89 
 
 
311 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.47 
 
 
324 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  32.2 
 
 
313 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.33 
 
 
315 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.55 
 
 
317 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.11 
 
 
308 aa  171  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.52 
 
 
321 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.23 
 
 
320 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.63 
 
 
322 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.49 
 
 
311 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
308 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  34.26 
 
 
307 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.37 
 
 
320 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.14 
 
 
315 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.49 
 
 
312 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.68 
 
 
305 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  30.94 
 
 
323 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  29.65 
 
 
313 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0839  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.56 
 
 
323 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  35.17 
 
 
320 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.98 
 
 
311 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.92 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.09 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.1 
 
 
306 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.71 
 
 
313 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  45.37 
 
 
214 aa  167  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.4 
 
 
325 aa  166  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.76 
 
 
316 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  31.6 
 
 
310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.33 
 
 
323 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.33 
 
 
311 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0996  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.81 
 
 
295 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0712  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.86 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1332  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.14 
 
 
323 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.28 
 
 
314 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1358  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.14 
 
 
323 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0557  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.86 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.689401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1022  riboflavin biosynthesis protein RibF  30.87 
 
 
315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1055  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.52 
 
 
305 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000443008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2818  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.22 
 
 
313 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  hitchhiker  0.00254748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  37.28 
 
 
309 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.26 
 
 
309 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1516  riboflavin biosynthesis protein RibF  30.26 
 
 
336 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.91 
 
 
338 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.65 
 
 
311 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.64 
 
 
296 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.19 
 
 
310 aa  161  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.67 
 
 
311 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.46 
 
 
306 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.32 
 
 
311 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  31.35 
 
 
327 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.1 
 
 
312 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1399  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.28 
 
 
323 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.804257  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3785  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  32.86 
 
 
313 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0688887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>