38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1417 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  84.48 
 
 		 174 aa  306  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  36.3 
 
 		 319 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  33.11 
 
 		 331 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  31.87 
 
 		 332 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  32.54 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  29.09 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  27.22 
 
 		 338 aa  60.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  27.22 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  26.63 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  34.94 
 
 		 123 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  32.05 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  24.63 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  26.14 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  32.98 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  32.1 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  26.09 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  21.53 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  25.29 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  29.71 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.05 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  30.86 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.87 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  24.34 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  24.07 
 
 		 148 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  28 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  39.13 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  28 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 		 316 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  24.63 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>