42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1120 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  897    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  64.2 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  64.37 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  64.37 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  63.76 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  62.59 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  40 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  37.71 
 
 		 469 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  37.39 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  39.95 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  37.73 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  37.53 
 
 		 536 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.81 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  35.75 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  36.39 
 
 		 538 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  37.09 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.45 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  35.31 
 
 		 478 aa  286  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  35.55 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  37.09 
 
 		 440 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  33.73 
 
 		 538 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  39.07 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  35.21 
 
 		 578 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  33.49 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  34.59 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  34.82 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  35.53 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  33.98 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  34.38 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  31.15 
 
 		 466 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  31.04 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  30.68 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  32.53 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  30.93 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  30.59 
 
 		 466 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  30.59 
 
 		 466 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  30.71 
 
 		 466 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  29.26 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  28.54 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  28.54 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  28.54 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>