44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3214 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3214  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  433  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0560  sporulation domain-containing protein  30.13 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1315  Sporulation domain protein  30.2 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2296  hypothetical protein  27.31 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  27.62 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 
265 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1608  Sporulation domain protein  25.97 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0218827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  36.92 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  29.03 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  28.72 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  27.41 
 
 
267 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  31.82 
 
 
254 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  31.58 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  33.33 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  28.41 
 
 
256 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  32.03 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.83 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  34.69 
 
 
324 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  33.87 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  34.69 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  34.69 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  34.69 
 
 
334 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  34.69 
 
 
324 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.94 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1639  sporulation repeat-containing protein  37.89 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  32.22 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  29.81 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  32.98 
 
 
344 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  26.92 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  27.05 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  30.91 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  29.21 
 
 
740 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  25.85 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  23.04 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  23.04 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  28.92 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
278 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  33.33 
 
 
278 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  29.47 
 
 
236 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  32.35 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  32.35 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.76 
 
 
257 aa  41.6  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>