60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_683 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  97.45 
 
 		 509 aa  998    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  93.71 
 
 		 509 aa  967    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  100 
 
 		 537 aa  1079    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  55.94 
 
 		 551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  56.58 
 
 		 538 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  56.95 
 
 		 538 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  53.52 
 
 		 540 aa  538  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.83 
 
 		 605 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  51.84 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.09 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  52.5 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.19 
 
 		 584 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  67.34 
 
 		 565 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  46.84 
 
 		 590 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  52.17 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.6 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.97 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  66.1 
 
 		 579 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.97 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  68.9 
 
 		 579 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  48.57 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  48.48 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  46.34 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  60.98 
 
 		 335 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  39.96 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  38.8 
 
 		 322 aa  220  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  37.78 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  36.31 
 
 		 386 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  33.44 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  28.33 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  26.21 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  26.84 
 
 		 294 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  25.89 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.47 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  26.2 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  30.3 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  25.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  25.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  25.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  25.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  25.41 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  27.97 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  25.47 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  23.68 
 
 		 308 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  25.93 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  23.99 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  30.64 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  32.26 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  27.33 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  24.73 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  30.2 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  26.01 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  28.24 
 
 		 332 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  29.7 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  26.06 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  26.97 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  27.27 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  24 
 
 		 342 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  26.5 
 
 		 862 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  24.62 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>