14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2490 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  44.69 
 
 
306 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  44.65 
 
 
319 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  38.7 
 
 
337 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  39.72 
 
 
324 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  43.19 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  34.87 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  34.42 
 
 
270 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2050  hypothetical protein  27.17 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  42.57 
 
 
404 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  27.35 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3718  hypothetical protein  31.98 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0734193  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1529  hypothetical protein  28.09 
 
 
316 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.493969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>