11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2348 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  84.92 
 
 		 337 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  54.9 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  40.64 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  39.73 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  36.69 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  39.8 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  29.7 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  46.22 
 
 		 404 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  27.31 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  27.34 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>