13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  44.91 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  39.66 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  42.96 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  37.99 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  35.79 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  38.32 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  42.71 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  35.46 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  51.02 
 
 		 404 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  26.87 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3718  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0734193  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1529  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.493969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>