11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6446 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  35.59 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  34.43 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  35.22 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  29.64 
 
 		 334 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  35.29 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  27.34 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  26.29 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  27.13 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  27.31 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  54.72 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>