255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2696 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 404 aa  803    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4522  arsenical-resistance protein  79.39 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  86.73 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4609  arsenical-resistance protein  79.39 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  82.19 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4905  arsenical-resistance protein  79.39 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  85.31 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1442  arsenical-resistance protein  81.53 
 
 		 369 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  78.67 
 
 		 363 aa  358  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  76.32 
 
 		 368 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  76.71 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  77.36 
 
 		 369 aa  341  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  76.96 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  76.53 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  81.86 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  74.18 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  73.24 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  71.76 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  72.35 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  69.37 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  68.66 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  68.26 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  73.43 
 
 		 356 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  70.05 
 
 		 378 aa  310  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  71.83 
 
 		 350 aa  307  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  68.92 
 
 		 360 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  71.23 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  68.47 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  63.43 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  67.44 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  56.73 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  54.33 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  53.37 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  53.37 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  53.85 
 
 		 346 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  53.85 
 
 		 346 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  53.37 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  51.6 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  53.85 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  53.39 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  53.85 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  52.89 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  52.4 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  53.74 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  54.33 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  55.26 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  53.37 
 
 		 346 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  54.33 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  55.29 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  54.82 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  56.44 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  48.89 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  52.4 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  55.77 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  54.72 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  56.02 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  51.2 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  53.95 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  52.4 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  52.58 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  48.85 
 
 		 350 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  50.47 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  52.61 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  52.88 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  50.24 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  51.66 
 
 		 350 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  49.52 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  52.88 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  50 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  51.89 
 
 		 353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  50.24 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  49.31 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  50 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  49.06 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  50.96 
 
 		 354 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  49.32 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  50 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  50.48 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  52.6 
 
 		 328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  53.12 
 
 		 328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  50 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  51.92 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  53.4 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  52.88 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  50.72 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  50.72 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  48.43 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  49.07 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  50.23 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  49.53 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  50.72 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  48.51 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  48.56 
 
 		 343 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  53.62 
 
 		 355 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  55 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  47.6 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  49.76 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  49.77 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  47.2 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  48.08 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>