12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1546 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  43.62 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  39.86 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  40.43 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  44.04 
 
 		 319 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  39.5 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  34.88 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  38.64 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  28.98 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  47 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3718  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0734193  normal  0.0692801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>