More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0473 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  63.46 
 
 		 480 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  62.74 
 
 		 470 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  63.82 
 
 		 470 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  63.89 
 
 		 476 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  63.52 
 
 		 470 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  61.75 
 
 		 485 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  63.68 
 
 		 476 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  68.74 
 
 		 469 aa  694    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  64.01 
 
 		 465 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  63.16 
 
 		 470 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  63.01 
 
 		 470 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  63.82 
 
 		 465 aa  651    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  74.79 
 
 		 468 aa  736    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  64.04 
 
 		 470 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  63.3 
 
 		 487 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  64.44 
 
 		 465 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  63.71 
 
 		 479 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  72.53 
 
 		 469 aa  715    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  100 
 
 		 467 aa  962    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  63.38 
 
 		 485 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  71.55 
 
 		 470 aa  695    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  63.35 
 
 		 472 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  63.73 
 
 		 490 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  62.39 
 
 		 481 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  63.25 
 
 		 470 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  63.68 
 
 		 482 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  63.3 
 
 		 472 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  63.94 
 
 		 477 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  67.4 
 
 		 473 aa  658    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  63.68 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  61.75 
 
 		 485 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  61.54 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  62.45 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  62.18 
 
 		 479 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  62.66 
 
 		 487 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  61.51 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  61.32 
 
 		 481 aa  628  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  61.37 
 
 		 483 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  62.39 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  61.93 
 
 		 487 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  64.77 
 
 		 477 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  61.93 
 
 		 487 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  61.93 
 
 		 487 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  62.64 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  62.64 
 
 		 465 aa  624  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  62.64 
 
 		 465 aa  624  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  62.64 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  60.9 
 
 		 479 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  62.64 
 
 		 465 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  63.23 
 
 		 478 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  62.42 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  62.42 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  62.42 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  62.2 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  62.64 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  62.47 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  61.32 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  59.01 
 
 		 499 aa  616  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  60.31 
 
 		 552 aa  615  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  61.51 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  61.54 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  61.29 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  63.46 
 
 		 475 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  60.61 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  61.56 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  60.61 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  60.75 
 
 		 472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  60.83 
 
 		 466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  59.21 
 
 		 472 aa  594  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  58.23 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  56.84 
 
 		 467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  58.11 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  54.85 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  55.6 
 
 		 475 aa  545  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  55.74 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  55.53 
 
 		 476 aa  538  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  53.29 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  53.86 
 
 		 476 aa  529  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  53.95 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  53.55 
 
 		 476 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  54.46 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  53.36 
 
 		 475 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  55.94 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  53.91 
 
 		 486 aa  511  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  53.15 
 
 		 469 aa  511  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  53.14 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  53.14 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  53.2 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  51.95 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  54.07 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  50.96 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  50.77 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  48.28 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  51.71 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  47.68 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  46.33 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  43.79 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  43.88 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.03 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  41.81 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>