More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3356 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
346 aa  686  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  86.42 
 
 
346 aa  612  1e-174  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  87.28 
 
 
346 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  86.71 
 
 
346 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  84.39 
 
 
346 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  86.71 
 
 
346 aa  571  1e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  75.59 
 
 
343 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  73.91 
 
 
347 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.97933e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  73.33 
 
 
347 aa  516  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.83454e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  73.62 
 
 
347 aa  515  1e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  74.78 
 
 
347 aa  516  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.81914e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  73.33 
 
 
347 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.07423e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  73.33 
 
 
347 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  71.97 
 
 
347 aa  504  1e-142  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.22229e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  69.5 
 
 
344 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  68.8 
 
 
344 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  68.22 
 
 
344 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  68.51 
 
 
344 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  68.22 
 
 
344 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  68.51 
 
 
344 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  67.93 
 
 
344 aa  492  1e-138  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  70.43 
 
 
347 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.6828e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  68.7 
 
 
348 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.8278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  68.51 
 
 
344 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
343 aa  454  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  63.61 
 
 
343 aa  453  1e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 
343 aa  452  1e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  4.55643e-09 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  63.5 
 
 
340 aa  453  1e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 
346 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.02365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  63.74 
 
 
346 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
343 aa  446  1e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.77131e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  63.95 
 
 
343 aa  444  1e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  63.16 
 
 
354 aa  445  1e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 
348 aa  446  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 
347 aa  446  1e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  1.88341e-06 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  63.53 
 
 
344 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  65.38 
 
 
347 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.38277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  65.59 
 
 
344 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.97097e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.54905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  64.79 
 
 
347 aa  439  1e-122  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  64.31 
 
 
347 aa  438  1e-122  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.1141e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.07307e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.36359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  6.17813e-05  normal  0.0424676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.27973e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  1.55968e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  6.01391e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.07844e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.18605e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  63.02 
 
 
342 aa  439  1e-122  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  62.87 
 
 
346 aa  439  1e-122  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.38726e-07  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  440  1e-122  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  6.4313e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
347 aa  441  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.73686e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
347 aa  437  1e-121  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  64.79 
 
 
336 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
339 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.59245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 
340 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  62.83 
 
 
349 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.06946e-05  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  61.74 
 
 
346 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  61.9 
 
 
368 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
343 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 
340 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.87033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  62.83 
 
 
349 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.43177e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  62.32 
 
 
348 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  5.73376e-09 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.22 
 
 
344 aa  433  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  62.83 
 
 
348 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 
342 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  61.95 
 
 
349 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  7.01456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  62.83 
 
 
348 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.95 
 
 
350 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.83 
 
 
344 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
343 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 
347 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  60.47 
 
 
343 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  62.91 
 
 
345 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  63.1 
 
 
342 aa  424  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
349 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.19946e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
349 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.18886e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
349 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.45532e-07  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  62.91 
 
 
345 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  62.43 
 
 
347 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.47765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  64.79 
 
 
347 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 
347 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.33641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  63.02 
 
 
347 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.9673e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  62.8 
 
 
347 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
349 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.91443e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  61.34 
 
 
346 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 
347 aa  424  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.19217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  61.52 
 
 
345 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  63.13 
 
 
349 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.92935e-07  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 
347 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  61.05 
 
 
346 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  59.35 
 
 
343 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>