32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0048 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.43033e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  89.33 
 
 
75 bp  85.7  1e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  94.23 
 
 
72 bp  79.8  8e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  97.56 
 
 
72 bp  73.8  5e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  97.56 
 
 
75 bp  73.8  5e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.56836e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  95 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  95 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  97.06 
 
 
76 bp  60  8e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  92.86 
 
 
72 bp  60  8e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  90.38 
 
 
76 bp  56  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  90.48 
 
 
76 bp  52  2e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  96.67 
 
 
74 bp  52  2e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  90.48 
 
 
76 bp  52  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  87.76 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  87.76 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  87.76 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    96.43 
 
 
378 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  84.72 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    96.43 
 
 
377 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.46939e-05  hitchhiker  1.09613e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    96.15 
 
 
376 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    96.15 
 
 
376 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    96.15 
 
 
384 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  93.33 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.575368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>