More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0602 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  98.36 
 
 
305 aa  617  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  90.82 
 
 
305 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.89 
 
 
322 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.33 
 
 
312 aa  225  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.01 
 
 
322 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.7 
 
 
320 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.62 
 
 
320 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.82 
 
 
314 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.52 
 
 
314 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.1 
 
 
311 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.89 
 
 
313 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.07 
 
 
316 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
310 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.2 
 
 
323 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.75 
 
 
313 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.57 
 
 
328 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  39.73 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  40.48 
 
 
328 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
316 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.54 
 
 
369 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  39.46 
 
 
328 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.8 
 
 
306 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0613  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.64 
 
 
319 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.2 
 
 
323 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.49 
 
 
311 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.8 
 
 
306 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.64 
 
 
317 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.91 
 
 
314 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.24 
 
 
308 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.29 
 
 
311 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1273  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.37 
 
 
296 aa  193  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.609723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.7 
 
 
330 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.81 
 
 
320 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.04 
 
 
314 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.11 
 
 
311 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.8 
 
 
325 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  37.89 
 
 
307 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  36.65 
 
 
307 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  38.46 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.29 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.11 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  37.87 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.36 
 
 
311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.57 
 
 
309 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.93 
 
 
315 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.14 
 
 
294 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.38 
 
 
319 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.23 
 
 
309 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.24 
 
 
308 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.05 
 
 
317 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.46 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.89 
 
 
316 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000276726  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.87 
 
 
323 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.06 
 
 
314 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.06 
 
 
309 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.76 
 
 
529 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.13 
 
 
322 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.71 
 
 
313 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.41 
 
 
310 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.79 
 
 
309 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
310 aa  185  8e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.43 
 
 
311 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.34 
 
 
312 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.04 
 
 
311 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.8 
 
 
311 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.98 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.71 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.72 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.82 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1055  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.74 
 
 
305 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000443008  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.73 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.97 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.62 
 
 
323 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.84 
 
 
311 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.52 
 
 
311 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3557  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.37 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.02 
 
 
310 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.46 
 
 
317 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.3 
 
 
318 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.94 
 
 
356 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1809  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.58 
 
 
303 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.08 
 
 
311 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.62 
 
 
313 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.52 
 
 
321 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  38 
 
 
325 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.49 
 
 
307 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.18 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.82 
 
 
311 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.16 
 
 
311 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.16 
 
 
311 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.24 
 
 
310 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.25 
 
 
314 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.29 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.06 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.49 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.49 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>