More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4908 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4908  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  879    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1597  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73 
 
 
430 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4311  glutamate dehydrogenase (NADP)  73.16 
 
 
428 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577025  normal  0.435234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0750  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.3 
 
 
430 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0779  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.3 
 
 
430 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2344  hypothetical protein  57.68 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1836  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  55.19 
 
 
424 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000665006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02946  NADP-specific glutamate dehydrogenase  54.15 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0227  glutamate dehydrogenase, putative  54.16 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0218  putative glutamate dehydrogenase  54.16 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0300  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.68 
 
 
421 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5459  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.89 
 
 
420 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  54.01 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1485  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.32 
 
 
416 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.491869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1591  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  50.24 
 
 
416 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1973  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  49.04 
 
 
416 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0445  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.72 
 
 
423 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3997  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.2 
 
 
415 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0997  glutamate dehydrogenase  48.77 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3799  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  47.96 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000116161  hitchhiker  0.0000000000363734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.79 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0550641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  47.96 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000659966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1617  glutamate dehydrogenase  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1401  glutamate dehydrogenase  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1373  glutamate dehydrogenase  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.02458e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1372  glutamate dehydrogenase  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0958  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  47.3 
 
 
428 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.323715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1511  glutamate dehydrogenase  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000126208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1652  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0977  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.3 
 
 
428 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1413  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.48 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1585  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  47.72 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25927e-30 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0805  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.51 
 
 
419 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0603  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.93 
 
 
412 aa  392  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  46.81 
 
 
414 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1790  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.16 
 
 
416 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.152655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1713  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  49.14 
 
 
420 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.494068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2404  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.47 
 
 
427 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00345076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1214  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.72 
 
 
427 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2689  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.24 
 
 
421 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.654737  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4511  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.54 
 
 
419 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2621  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.23 
 
 
419 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1722  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  47.95 
 
 
417 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1313  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.69 
 
 
430 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1272  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.68 
 
 
426 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865118  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3761  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.3 
 
 
432 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.060443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1064  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.76 
 
 
427 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0724  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.36 
 
 
421 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0596  glutamate dehydrogenase (NADP)  47.83 
 
 
440 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4115  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.72 
 
 
422 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.764753  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4385  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.88 
 
 
421 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5648  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.05 
 
 
424 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1731  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  49.16 
 
 
416 aa  378  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1505  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.75 
 
 
445 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0456  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  46.1 
 
 
435 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1204  glutamate dehydrogenase (NADP)  47.36 
 
 
429 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2574  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.08 
 
 
430 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3363  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.06 
 
 
437 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39653  hitchhiker  0.00000359206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0398  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.85 
 
 
435 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0305  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.28 
 
 
427 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.256409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0480  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  47.56 
 
 
433 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.51 
 
 
417 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3754  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.27 
 
 
428 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0356  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.07 
 
 
433 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0185  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.02 
 
 
428 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.484699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0635  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.02 
 
 
428 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400076  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2715  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.77 
 
 
428 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0668  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.02 
 
 
428 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3265  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.12 
 
 
419 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.45 
 
 
418 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.058595  normal  0.571657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.56 
 
 
439 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0371  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.59 
 
 
433 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4038  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.87 
 
 
426 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2439  glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3435  glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.373293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1224  glutamate dehydrogenase  45.77 
 
 
434 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0179  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.63 
 
 
436 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.02 
 
 
428 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3239  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.56 
 
 
438 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0045949  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0563  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.52 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.794737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0353  glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1212  glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3397  putative glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3432  putative glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2623  glutamate dehydrogenase  46.02 
 
 
434 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2721  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerization region  46 
 
 
427 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2938  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  45.61 
 
 
419 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671326  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1045  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.32 
 
 
412 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3380  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.6 
 
 
431 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.34 
 
 
440 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1583  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.34 
 
 
431 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1074  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.91 
 
 
428 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00880  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  45.28 
 
 
426 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0211  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.37 
 
 
434 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2942  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.33 
 
 
431 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2473  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.02 
 
 
424 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0188  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.37 
 
 
433 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3671  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.17 
 
 
426 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  47.48 
 
 
712 aa  363  4e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3400  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.85 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>