36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4799 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  64.52 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  60.65 
 
 
158 aa  204  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  64.08 
 
 
158 aa  200  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  60 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  59.35 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  58.04 
 
 
159 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  55.94 
 
 
156 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  41.03 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  42.03 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  42.34 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  42.45 
 
 
152 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  41.5 
 
 
155 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  44.03 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  38.41 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  40.28 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  39.07 
 
 
155 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  39.1 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  38.22 
 
 
155 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  38.22 
 
 
155 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  36.71 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  37.32 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  39.31 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  43.26 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  42.45 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  36.36 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  39.85 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  36.69 
 
 
160 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  40.58 
 
 
154 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>