19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2870 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  958    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  55.56 
 
 
416 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  42.4 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  31.85 
 
 
435 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  31.31 
 
 
435 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  32.54 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  33.42 
 
 
454 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  31.05 
 
 
485 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
465 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
470 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  28.95 
 
 
354 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  27.27 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.48 
 
 
883 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  24.16 
 
 
437 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  26.27 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  22.67 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  32.56 
 
 
108 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  27.86 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>