More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0573 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  48.96 
 
 
241 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.15 
 
 
247 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.56 
 
 
237 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  40.91 
 
 
236 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  44.12 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  42.04 
 
 
245 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  38.74 
 
 
253 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  41.32 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  42.13 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  42.13 
 
 
239 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
395 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  39.26 
 
 
394 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  42.32 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.98 
 
 
319 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
249 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  40.48 
 
 
257 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  38.02 
 
 
250 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 
313 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 
252 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 
597 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.25 
 
 
416 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.92 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  40.96 
 
 
318 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  38.52 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  37.04 
 
 
252 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.47 
 
 
611 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  38.11 
 
 
250 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
250 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.75 
 
 
452 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.59 
 
 
238 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  36.59 
 
 
250 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  36.59 
 
 
250 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 
270 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  36.18 
 
 
250 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  36.18 
 
 
250 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  36.18 
 
 
250 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  36.18 
 
 
250 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 
389 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  36.18 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.95 
 
 
463 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.12 
 
 
425 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  36.48 
 
 
261 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.95 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40.08 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  35.71 
 
 
348 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  37.74 
 
 
256 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.86 
 
 
507 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.32 
 
 
417 aa  158  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  34.17 
 
 
261 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  36.43 
 
 
280 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  39.76 
 
 
241 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  35.39 
 
 
269 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
422 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  35.54 
 
 
472 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.39 
 
 
466 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
386 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
268 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  35.95 
 
 
256 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
259 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
574 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  32.94 
 
 
548 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 
462 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  34.15 
 
 
266 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
259 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 
256 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  34.3 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  36.93 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  36.93 
 
 
259 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
477 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.78 
 
 
438 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  35.57 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  36.05 
 
 
435 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 
419 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  36.63 
 
 
250 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1339  protein serine/threonine phosphatase  38.58 
 
 
258 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172289  normal  0.468811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  32.51 
 
 
271 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 
540 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.25 
 
 
381 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.74 
 
 
243 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.71 
 
 
426 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  32.53 
 
 
443 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
240 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.51 
 
 
271 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.57 
 
 
322 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  36.61 
 
 
256 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 
538 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.61 
 
 
256 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  37.5 
 
 
445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  36.51 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
449 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>