19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0076 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0076  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  239  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0133751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  56.06 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  38.24 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  40.96 
 
 
204 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  39.08 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  41.1 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  35.21 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  32.04 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  28.04 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  35.59 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  32.29 
 
 
115 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  35 
 
 
87 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  34.72 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  39.66 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  32.89 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  32.89 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>