24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4253 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  341  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  31.85 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  30.37 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  30.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  36.79 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  35.63 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  32.8 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  30.48 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  33.62 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  30.89 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  34.74 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>