32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3980 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  35.85 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  38.5 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  32.56 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  34.88 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  33.01 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  31.02 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  33.19 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  32.23 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  30.63 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  32.5 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  30.14 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  32.21 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  33.51 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  26.03 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 455 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  26.29 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  27.85 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  25 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.65 
 
 		 500 aa  45.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  30.11 
 
 		 457 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  26.95 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  24.38 
 
 		 171 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  26.09 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  22.95 
 
 		 188 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  27.01 
 
 		 424 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>