137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3964 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  55.52 
 
 		 291 aa  345  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6572  methyltransferase  38.95 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  32.72 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  32.35 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  30.95 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  33.21 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  36.84 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  32.5 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  30.04 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  32.1 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  35.33 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  29.82 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3997  putative methyltransferase  30.22 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263514  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 630 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 604 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 630 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 604 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 604 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 659 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 648 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 604 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  34.31 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  29.95 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 639 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  31.87 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  42.25 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  32.12 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  35.89 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  35.41 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  34.08 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  27.34 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  32.02 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  34.48 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  28.91 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  30.41 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  28.91 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0164  putative methyltransferase  28.69 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  36.17 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  31.19 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  27.08 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  37.32 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  37.32 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  26.83 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  34 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  34.29 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  36.81 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  31.19 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  30.69 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  35.46 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  34.97 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  30.54 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  34.97 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  34.97 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  32.11 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  34.27 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  33.57 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  31.72 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  31.72 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  32.02 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  30.2 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  30.2 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  30.2 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  34.75 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  32.87 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  23.89 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  30.28 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  31.86 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  31.86 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  36.84 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  36.84 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  37.39 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  34.65 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  31.37 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  28.5 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  33.7 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  33.7 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  36.15 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  38.39 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  30.94 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  32.31 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  32.24 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>