More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2778 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  55.86 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  50.97 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  50.35 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  52.08 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  47.62 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  47.95 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  46.26 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  45.27 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  46.94 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  44.9 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  44.22 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  44.22 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  44.22 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  43.84 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  42.47 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  44.52 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  41.96 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  39.35 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  41.33 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  40.67 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  38.16 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  37.25 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  40.54 
 
 		 172 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  37.25 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  41.89 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  37.75 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  38.16 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0379  hypothetical protein  44.2 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000399241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  36.23 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  39.33 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.97 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.65 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  44.55 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  40.28 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  40.29 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  37.33 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  44.55 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  39.57 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.33 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.82 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.69 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.82 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38.19 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  39.86 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  40.18 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  42.98 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.71 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  33.79 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  37.84 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  35.67 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  38.73 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0377  hypothetical protein  42.28 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.467717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.12 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  36.42 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  39.29 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>