More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2767 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  66.27 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  64.37 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  59.3 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  62.07 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  63.41 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  62.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  55.81 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  63.1 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>