More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0938 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
804 aa  751  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
833 aa  835  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
838 aa  746  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
816 aa  712  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
805 aa  883  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
971 aa  637  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
817 aa  642  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
825 aa  644  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
802 aa  884  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
808 aa  850  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
804 aa  843  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
805 aa  886  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 
801 aa  716  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
800 aa  719  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
971 aa  637  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
816 aa  635  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
816 aa  649  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
829 aa  815  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
829 aa  820  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
802 aa  877  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
971 aa  638  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  42.92 
 
 
879 aa  697  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
806 aa  733  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
804 aa  706  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
806 aa  758  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
805 aa  744  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
807 aa  1670  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
828 aa  641  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
802 aa  875  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
857 aa  707  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
807 aa  741  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
802 aa  878  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
840 aa  692  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
802 aa  885  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  46.55 
 
 
899 aa  759  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
805 aa  842  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
806 aa  862  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
802 aa  880  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
805 aa  842  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
806 aa  752  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
835 aa  705  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
802 aa  884  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
950 aa  642  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 
833 aa  834  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
936 aa  762  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
802 aa  884  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
802 aa  885  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
801 aa  757  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
805 aa  748  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
802 aa  884  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
805 aa  730  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
857 aa  722  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
802 aa  880  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
804 aa  874  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
858 aa  779  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
854 aa  735  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
819 aa  694  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
830 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.31776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
824 aa  635  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
816 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
952 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
814 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
819 aa  628  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
968 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
851 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.16015e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
951 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
824 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.90725e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
829 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
824 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
827 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
817 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
963 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
824 aa  615  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
837 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
934 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
949 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
906 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
984 aa  614  1e-174  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
954 aa  613  1e-174  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
823 aa  613  1e-174  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
952 aa  612  1e-174  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
810 aa  615  1e-174  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
824 aa  614  1e-174  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
968 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
819 aa  612  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
958 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
824 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
816 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
829 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
978 aa  607  1e-172  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
826 aa  606  1e-172  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
824 aa  608  1e-172  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
825 aa  603  1e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
828 aa  603  1e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
815 aa  602  1e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
829 aa  602  1e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
813 aa  604  1e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
969 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
813 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
824 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>