32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0136 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
331 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  74.62 
 
 
331 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  70.39 
 
 
331 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  71 
 
 
331 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  68.88 
 
 
331 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  64.95 
 
 
331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  65.45 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  51.51 
 
 
333 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  56.39 
 
 
332 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  54.31 
 
 
330 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  52.94 
 
 
335 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  53.05 
 
 
334 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  50.61 
 
 
330 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  51.63 
 
 
337 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  51.4 
 
 
334 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  48.81 
 
 
342 aa  318  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  51.3 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.21 
 
 
233 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.4 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  32.7 
 
 
249 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  29.26 
 
 
248 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  30.28 
 
 
244 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  25.94 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  26.32 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.56 
 
 
256 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  24.61 
 
 
254 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  23.57 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  30.18 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  26.97 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  26.24 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.55 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>