28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0288 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.8 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.78 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.41 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  29.35 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.38 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.38 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.87 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.87 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.17 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  26.74 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.65 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.29 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.81 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  29.58 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  33.66 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  28.75 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.97 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.54 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.93 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.85 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.01 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.78 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.05 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  25.77 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.86 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>