30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2280 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2440  hypothetical protein  67.58 
 
 		 187 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1865  hypothetical protein  59.24 
 
 		 199 aa  220  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0170  hypothetical protein  55.56 
 
 		 244 aa  210  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0257  hypothetical protein  55.19 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07650  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.692236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1093  hypothetical protein  27.44 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  29.7 
 
 		 298 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0447  hypothetical protein  27.16 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 		 306 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 511 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  34.94 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1303  conserved hypothetical protein, methyltransferase type 12 domain  26.36 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.193595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  25.47 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35.44 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 1314 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 251 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 244 aa  42  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  34.48 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 311 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.18 
 
 		 285 aa  41.2  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>