41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1095 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  335  2e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.52193e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  47.1 
 
 
255 aa  132  2e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  126  1e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  5.42792e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  50.41 
 
 
145 aa  117  1e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  6.37648e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  44.36 
 
 
353 aa  114  8e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  46.72 
 
 
267 aa  110  8e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  44.6 
 
 
182 aa  107  9e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  40.16 
 
 
177 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  40.7 
 
 
170 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  37.06 
 
 
288 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  41.8 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  31.38 
 
 
265 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  30.73 
 
 
188 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.77569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  36.52 
 
 
135 aa  82  3e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  72.8  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.59083e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  32.35 
 
 
184 aa  70.5  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  33.81 
 
 
195 aa  69.7  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  33.15 
 
 
203 aa  68.2  5e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  35.9 
 
 
173 aa  64.7  6e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  9.63449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  32.53 
 
 
188 aa  63.9  1e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  41.9 
 
 
177 aa  63.2  2e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  34.81 
 
 
232 aa  61.2  7e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  40.54 
 
 
214 aa  59.3  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  32.82 
 
 
202 aa  58.9  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  34.29 
 
 
316 aa  55.1  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  40.79 
 
 
183 aa  54.3  8e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.47838e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  52.8  2e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  51.2  7e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  51.2  8e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  30.49 
 
 
187 aa  48.1  6e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  31.21 
 
 
316 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  28.19 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.53163e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  29.87 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  27.61 
 
 
270 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  29.9 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  29.9 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.24261e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  32.67 
 
 
283 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  28.74 
 
 
328 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.69852e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  38.98 
 
 
59 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>