16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0293 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  63.03 
 
 
313 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  53.33 
 
 
270 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  52.08 
 
 
321 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  57.53 
 
 
316 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  42.5 
 
 
329 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  51.1 
 
 
283 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  65.71 
 
 
319 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  64 
 
 
319 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  38.61 
 
 
165 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  38.1 
 
 
165 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  29.57 
 
 
213 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  23.01 
 
 
3242 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  26.47 
 
 
1202 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>