More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0101 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0101  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000448145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2665  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00483372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  50.22 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0135  peptidase M22 glycoprotease  42.41 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1986  protease, putative  45.09 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0096  protease, putative  41.44 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0123  peptidase M22 glycoprotease  39.05 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000799659  hitchhiker  0.00871269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  33.18 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  32.59 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  32.59 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  32.59 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  32.59 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  32.59 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  32.59 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  32.59 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  33.04 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.59 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.84 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.84 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.84 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  31.84 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  31.84 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.59 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  29.68 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  38.93 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  38.93 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  38.93 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  40.32 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  38.76 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  29.31 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  33.49 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  33.17 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  38.76 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  36.88 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  35.66 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  38.58 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  35.38 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  28.76 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  36.84 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0778  hypothetical protein  43.75 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  34.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  37.4 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  31.52 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  35.94 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  33.59 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  33.07 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  27.15 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  34.38 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  36.43 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  32.81 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  40.16 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  27.71 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  32.56 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  29.07 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  39.84 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  30.26 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  35.11 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  35.77 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  35.66 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  34.35 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  31.78 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  33.59 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  28.45 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  36.51 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.81 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  34.11 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  35.66 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  36.43 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  30.71 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  34.11 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.03 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  33.59 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  30 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  30.23 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  27.81 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  32.54 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  30.71 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  31.78 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  33.08 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  30 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  33.6 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>