More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0091 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1986  protease, putative  51.33 
 
 
227 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2665  peptidase M22, glycoprotease  52.23 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00483372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0101  peptidase M22 glycoprotease  50.22 
 
 
226 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000448145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0096  protease, putative  49.77 
 
 
234 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0135  peptidase M22 glycoprotease  46.4 
 
 
230 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0123  peptidase M22 glycoprotease  41.43 
 
 
208 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000799659  hitchhiker  0.00871269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  31.08 
 
 
231 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  30.59 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  30.59 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  30.59 
 
 
231 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  30.59 
 
 
231 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  31.19 
 
 
233 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  30.8 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  30.8 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  30.14 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
232 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  30.36 
 
 
231 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  31.19 
 
 
233 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  30.28 
 
 
233 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  29.22 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  29.22 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  29.22 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.28 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  28.44 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  28.77 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  29.22 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  29.22 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  36.62 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  36.62 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  38.4 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 
237 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  33.8 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  38.89 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
229 aa  88.2  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  36.8 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  38.89 
 
 
239 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  31.41 
 
 
241 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  36.51 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  28.18 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  29.49 
 
 
238 aa  85.1  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  35.77 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  34.71 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.28 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  34.33 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  35.04 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  32.37 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  34.25 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  37.36 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  28.89 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  37.69 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  34.35 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  34.4 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  31.34 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  34.36 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  35.2 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  27.88 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  32.09 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  27.56 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  29.5 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  34.92 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  33.6 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  31.78 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  29.28 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  30.43 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  35.92 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  32.54 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  34.07 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  30.32 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  34.13 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  34.13 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  37.8 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  30.77 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  31.21 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  34.13 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  33.07 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  33.08 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  34.01 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  37.3 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.28 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  33.88 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  32.39 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  34.92 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  34.43 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  39.45 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  34.43 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  33.58 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  31.21 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.06 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  38.21 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.8 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  31.16 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  37.01 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  32 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  31.13 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>