More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0669 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  81.2 
 
 
400 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  81.45 
 
 
400 aa  651    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  100 
 
 
400 aa  800    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  80.2 
 
 
400 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  73.75 
 
 
401 aa  593  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  73.43 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  74 
 
 
400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  73.68 
 
 
399 aa  579  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  73.89 
 
 
404 aa  552  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  68.66 
 
 
403 aa  548  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  59.31 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  60.15 
 
 
406 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  58.27 
 
 
408 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  55.83 
 
 
411 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  55.33 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  55.33 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  56.44 
 
 
409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  55.09 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  58.52 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  55.42 
 
 
411 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  58.96 
 
 
405 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  56.44 
 
 
424 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  55.2 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  55.2 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  57.86 
 
 
405 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  54.46 
 
 
410 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  58.85 
 
 
407 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  54.68 
 
 
410 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  54.57 
 
 
428 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  58.6 
 
 
405 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  58.6 
 
 
404 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  55.22 
 
 
413 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  54.81 
 
 
413 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  57.71 
 
 
410 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  54.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  55.97 
 
 
408 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  58.6 
 
 
404 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  55.97 
 
 
408 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  56.72 
 
 
409 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  55.97 
 
 
409 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  57.21 
 
 
416 aa  421  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  56.61 
 
 
404 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  56.22 
 
 
406 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  56.4 
 
 
410 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  53.47 
 
 
408 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  55.83 
 
 
412 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  54.84 
 
 
410 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  54.68 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  55.09 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  53.94 
 
 
408 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  54.43 
 
 
414 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  53.96 
 
 
416 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  53.38 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  52.76 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  54.64 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  54.34 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  50.87 
 
 
427 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  53.24 
 
 
422 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  51.31 
 
 
423 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  51.87 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  54.24 
 
 
416 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  54.73 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  54.24 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  53 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  55.93 
 
 
416 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  52.98 
 
 
422 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  51.99 
 
 
409 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  54 
 
 
416 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  52.05 
 
 
419 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  54.7 
 
 
406 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  52.28 
 
 
423 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  51.5 
 
 
408 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  52.76 
 
 
422 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  52.98 
 
 
422 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  53.75 
 
 
416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  51.31 
 
 
423 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  51.55 
 
 
423 aa  395  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  53.03 
 
 
417 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  54.96 
 
 
416 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  53.03 
 
 
417 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  53.03 
 
 
417 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  50.25 
 
 
412 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  54.96 
 
 
416 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  52.52 
 
 
422 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  55.21 
 
 
416 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  53.03 
 
 
417 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  51.55 
 
 
424 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  52.52 
 
 
422 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  53.03 
 
 
417 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  53.75 
 
 
404 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  54.48 
 
 
416 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  51.09 
 
 
417 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  53.03 
 
 
416 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>