39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  27.86 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  26.47 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  31.76 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  30.43 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  25.68 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  24.71 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  25.43 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  23.47 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  27.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  23.59 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  24.4 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  27.86 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  24.86 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  25.5 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  23.08 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  25 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  22.64 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  26.53 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  27.27 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  22.36 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  25.56 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  27.47 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  25.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  21.47 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  25.95 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  21.74 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  27.27 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  25.45 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1683  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.91 
 
 		 803 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  22.15 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  21.43 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  21.43 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  21.43 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  24.28 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  20.78 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  24.55 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>