23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3075 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  35.85 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  35.85 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  46.55 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.93 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  44.83 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3821  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4232  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  23.81 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>