47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0063 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  100 
 
 
159 aa  314  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  55.2 
 
 
129 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  54.84 
 
 
129 aa  120  1e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  45.52 
 
 
131 aa  109  2e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  29.23 
 
 
148 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  29.75 
 
 
258 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.65 
 
 
148 aa  59.7  2e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.93 
 
 
261 aa  58.2  5e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  29.25 
 
 
139 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  27.61 
 
 
138 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  26.09 
 
 
140 aa  57  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1549  hypothetical protein  30.95 
 
 
245 aa  56.6  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  6.40295e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  28.06 
 
 
138 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.33 
 
 
261 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.57 
 
 
139 aa  53.9  9e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.71 
 
 
139 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.59 
 
 
254 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.71 
 
 
139 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  30.89 
 
 
168 aa  50.8  7e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  28.24 
 
 
230 aa  50.4  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  25.93 
 
 
104 aa  49.3  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  29.35 
 
 
102 aa  49.3  2e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  28 
 
 
100 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  29.03 
 
 
257 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  25.23 
 
 
98 aa  48.1  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  26.36 
 
 
142 aa  47.4  9e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  34.15 
 
 
108 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  25.23 
 
 
113 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  26.32 
 
 
194 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2853  hypothetical protein  26.67 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2538  hypothetical protein  25.71 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  24.11 
 
 
108 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  25 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  27.97 
 
 
309 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25.58 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  26.8 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  23.77 
 
 
292 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  29.63 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  27.93 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  27.12 
 
 
322 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  24.79 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  22.94 
 
 
128 aa  41.2  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  24.14 
 
 
284 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.21 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.21 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  31.53 
 
 
119 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  30.77 
 
 
182 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>