29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0049 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  45.24 
 
 
103 aa  79  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  43.02 
 
 
94 aa  73.2  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  40.51 
 
 
336 aa  57.8  5e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  38.96 
 
 
91 aa  53.5  8e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  35.21 
 
 
360 aa  52  3e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  8.26117e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.14 
 
 
292 aa  51.2  5e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.14 
 
 
288 aa  50.8  5e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  35.14 
 
 
285 aa  51.2  5e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  31.43 
 
 
329 aa  48.5  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  36.84 
 
 
363 aa  47.4  6e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  35.09 
 
 
393 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 
278 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
283 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  32.47 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  32.39 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  27.5 
 
 
203 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.7167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  36.76 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1028  putative transmembrane transcriptional regulator  35.59 
 
 
235 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  34.48 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.20688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  31.08 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  27.94 
 
 
203 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  34.48 
 
 
212 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  29.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  30.49 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  36 
 
 
371 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4633  putative transmembrane anti-sigma factor  42.31 
 
 
279 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>