More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7999 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  74.11 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  67.86 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  71.3 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  65.74 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  64.81 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  63.89 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  63.39 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  58.33 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>