19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7308 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  7.49019e-09  hitchhiker  9.83885e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  31.49 
 
 
291 aa  153  3e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  31.01 
 
 
490 aa  134  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  25.1 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  26 
 
 
300 aa  76.3  6e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  4.06719e-10  unclonable  1.55562e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  25.73 
 
 
300 aa  73.6  4e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.33 
 
 
301 aa  72  1e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  24.21 
 
 
292 aa  61.6  1e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  25.5 
 
 
298 aa  58.5  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  26.16 
 
 
434 aa  56.6  4e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  22.73 
 
 
293 aa  52  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  25.68 
 
 
423 aa  51.6  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  2.13226e-08 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  29.8 
 
 
428 aa  50.8  3e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  21.01 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  23.6 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  24.16 
 
 
365 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13910  hypothetical protein  25.26 
 
 
315 aa  42.7  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>