122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1480 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  52.05 
 
 
164 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3405  hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.460418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  46.05 
 
 
174 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  44.44 
 
 
159 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  38.36 
 
 
158 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  40.52 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1614  hypothetical protein  39.6 
 
 
152 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  41.73 
 
 
134 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4145  hypothetical protein  36.84 
 
 
202 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  38.64 
 
 
168 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  39.1 
 
 
144 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  38.71 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  38.76 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  37.41 
 
 
176 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  41.38 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  37.6 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  37.6 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  36.8 
 
 
150 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  33.11 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  39.81 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  31.71 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  34.78 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  33.58 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  38.14 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  38.14 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  37.29 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  37.96 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  37.01 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  38.14 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  35.59 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  35.59 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  34.68 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  34.75 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  36.72 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  35.16 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  35.92 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2498  hypothetical protein  35.06 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  37.62 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  37.19 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  35.48 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  29.03 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  32.24 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  31.29 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  31.29 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  31.29 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  33.07 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  33.03 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  38.53 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  38.02 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0176  hypothetical protein  35.81 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  38.53 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  38.02 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  38.53 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  38.02 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  35.92 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.86 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  35.4 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0372  hypothetical protein  34.72 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  34.86 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  30.15 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  36.59 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  34.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1823  hypothetical protein  36.54 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00900716  normal  0.0800566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  36.07 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.96 
 
 
274 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  34.11 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  35.21 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  34.55 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.78 
 
 
324 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  33.6 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  31.36 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  34.65 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  33.01 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  33.05 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  29.27 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  32.58 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  32.58 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  32.58 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  31.2 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  31.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  33.06 
 
 
311 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0071  hypothetical protein  36.61 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>