249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4970 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  823    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  69.7 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  69.19 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  68.69 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  68.18 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  68.43 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  68.69 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  68.69 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  68.18 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  68.43 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  68.43 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  68.83 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  67.93 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  67.58 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  69.19 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  68.18 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  68.18 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  53.54 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  51.89 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 396 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  51.64 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  46.95 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  46.84 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  46.95 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  46.45 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  43.29 
 
 		 395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 398 aa  359  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  44.39 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  43.43 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  41.92 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  41.56 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 406 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  42.71 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 398 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  43.69 
 
 		 398 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  43.69 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4005  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143022  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  41.92 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  43.69 
 
 		 399 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  43.43 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  43.86 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>