71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3684 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  36.26 
 
 
556 aa  305  1e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  34.91 
 
 
556 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  33.87 
 
 
563 aa  285  2e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  33.87 
 
 
563 aa  284  3e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  33.81 
 
 
563 aa  283  5e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  33.88 
 
 
563 aa  279  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  34.3 
 
 
562 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  36.07 
 
 
562 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04321e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  36.07 
 
 
562 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  35.15 
 
 
562 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  35.88 
 
 
562 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  33.4 
 
 
554 aa  275  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  32.53 
 
 
556 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  33.16 
 
 
555 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  34.71 
 
 
556 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  31.43 
 
 
552 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  29.09 
 
 
551 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  31.13 
 
 
556 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  31.09 
 
 
547 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  29.84 
 
 
562 aa  236  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  30.75 
 
 
559 aa  223  1e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  29.69 
 
 
566 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  29.2 
 
 
544 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.93022e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  27.91 
 
 
565 aa  183  8e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  26.76 
 
 
534 aa  173  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  31.64 
 
 
546 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  26.59 
 
 
546 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  30.3 
 
 
545 aa  164  4e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  29.63 
 
 
541 aa  148  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  24.66 
 
 
538 aa  142  1e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  28.75 
 
 
622 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.79847e-05  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  26.58 
 
 
611 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  30.86 
 
 
656 aa  135  2e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  27.18 
 
 
542 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  28.68 
 
 
530 aa  132  2e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  32.28 
 
 
532 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  26 
 
 
660 aa  131  4e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.13292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  27.32 
 
 
467 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  28.17 
 
 
459 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.75912e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  26.46 
 
 
462 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  25.32 
 
 
461 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  21.6 
 
 
501 aa  100  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  34.18 
 
 
543 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  32 
 
 
603 aa  98.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  31.4 
 
 
455 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  24.78 
 
 
463 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  25.66 
 
 
462 aa  95.1  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  27.22 
 
 
455 aa  94  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  26.91 
 
 
525 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  35.29 
 
 
691 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.13 
 
 
467 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  23.96 
 
 
653 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  27.07 
 
 
527 aa  87  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  27.1 
 
 
530 aa  84  6e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  24.54 
 
 
634 aa  83.6  9e-15  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  27.7 
 
 
381 aa  82.8  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  24.56 
 
 
529 aa  81.3  4e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  24.35 
 
 
484 aa  80.9  6e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  23.57 
 
 
520 aa  77.8  5e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  27.72 
 
 
578 aa  76.6  1e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  26.01 
 
 
509 aa  75.5  2e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  24.56 
 
 
456 aa  73.6  1e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  33.11 
 
 
603 aa  71.2  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  22 
 
 
728 aa  70.9  5e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24 
 
 
629 aa  68.2  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  30.12 
 
 
574 aa  59.7  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  25.11 
 
 
371 aa  57.8  6e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  24.82 
 
 
378 aa  55.1  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  22.78 
 
 
598 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.08473e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>