27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1552 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  44.06 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  41.5 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  41.18 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  39.6 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  35.86 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.75 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  23.5 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.56 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.53 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  24.75 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.87 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.5 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  25.12 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  25.14 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  21.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  22.89 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  24.21 
 
 		 245 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  21.81 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  25.6 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  25.35 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  24.61 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>